El molino de martillos es el molino más utilizado y uno de los más antiguos. Los molinos de martillos consisten en una serie de martillos (generalmente cuatro o más) articulados sobre un eje central y encerrados dentro de una caja metálica rígida. Produce reducción de tamaño por impacto.
Los materiales a fresar son golpeados por estas piezas rectangulares de acero endurecido (martillo agrupado) que giran a gran velocidad dentro de la cámara. Estos martillos que oscilan radicalmente (desde el eje central giratorio) se mueven a una alta velocidad angular provocando una fractura frágil del material de alimentación.
Excelente diseño para hacer posible la esterilización en línea o fuera de línea.